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研究报告与学术论文在内容要求上存在着一定的差别。一般来说，论文比较简洁精炼，它仅仅突出表达一项研究工作中最主要、最精彩和具有创造性的内容。论文含有新的见解或形成新的解释、新论点、新理论，没有一般研究过程的叙述，也没有过多的具体材料；而科研报告则可以将整个研究工作的重要过程、方法和环节都写进去。
研究报告与学术论文在创新性方面存在差别。在创新性方面，学术论文必须在充分占有大量文献资料的基础上提出新见解、新理论，以补充已有研究的不足，纠正流行说法偏差，填补研究的空白，达到现有研究的新高；而研究报告则注重陈述研究过程的事实和数据，说明问题，不一定必须要有创新性观点的形成。
研究报告与学术论文在论证过程中存在差别。就论证过程来说，学术论文是以“论”成文的，论文作者要运用严谨规范的科学语言、形式和专业的术语概念，来论说所持的观点见解，论证所提出的理论模式，做到就事论理、以理服人，论述深刻、充分，论证严密、透彻，论断精当、公允，论据可靠、确凿，同时还要有较高的推理成分，具有较强的论理性；而研究报告则注重用事实与数据来说明和揭示某一问题或现象，主要凭事实和数据说话。
